水产养殖生产的实践表明：池塘保留15厘米～20厘米厚的淤泥，能起到保肥、供肥、缓冲水质等作用。
但是鱼塘经过一段时间后，由于经常沉积一些残剩饵料、肥料、死亡生物、鱼类粪便及其它有机质，加上泥沙的混合，使池底逐渐形成了一定厚度的淤泥。当淤泥厚度超过20厘米后，便会对塘鱼产生十分不利的影响。这是因为，淤泥中含有大量有机质，在温度较高时会发生分解，一方面在分解过程中会大量消耗水中溶氧，使鱼池严重缺氧而造成泛塘死鱼；另一方面分解中会产生大量对鱼类有害的氨、硫化氢、甲烷、有机酸等，影响鱼类生长，甚至造成鱼类中毒死亡。如果每年秋冬捕捞后能够干塘一次，将过多的淤泥挖起，经过一段时间的曝晒、冷冻，使有机物质分解，消除有毒成分，再作为肥料撒入池塘，或者挖起淤泥后拌上生石灰撒入池塘，这样既能杀死有害病菌，也能中和有机酸，释放营养盐类，使水质变肥且能增加水中钙质。同时加入EM菌调节水质。对不能挖起淤泥的池塘，可选择晴天和有风天气，搅动池底，最好半月一次，促进池底部有机质分解，释放营养盐类，防止水质老化。
根据测定，精养鱼塘的积淤厚度一般以每年10厘米左右的速度递增。池塘淤泥的改良，一般在冬春季节进行。首先，排干池水，进行人工或泥浆泵等机械清淤；然后，冻土晒塘，在灌水投入使用前，用生石灰消毒;灌水后加入EM菌调解水质，也可与种植农作物轮作,这样可以使淤泥更充分地干透，靠陆生作物发达的根系，使土地疏松，有利于有机物的矿化分解，更好地改良池底。
在平时养殖生产过程中，条件允许的可借助潜走式水下清淤机、进行带水清淤，也可在池塘中种植一些挺水或沉水植物，吸收底泥中的有机质，以达到改良淤泥的作用。
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