巴氏杀菌流水线精确地控制好巴氏杀菌单位是良好的杀菌过程的要求。良好的杀菌过程是什么?
以最小的巴氏杀菌单位，产品质量和新鲜程度的最佳优化的杀菌过程最大地保持。由先进的巴氏杀菌单位控制系统进行调节的结果是最佳优化的杀菌过程，这一系统完全能够确保产品不被欠杀菌，并杀菌过程得到最小。
以产品的巴氏杀菌单位为作用基础的是先进的巴氏杀菌单位控制系统，而不是产品的温度。这一控制系统不但可以充分确定出复杂的控制决策，而且还能够利用通过监测所得到的产品的处理历史数据。这个由计算机组成控制系统，当前的状况通过智能动作采集，根据巴氏杀菌流水线中产品的所有当前状态，进行变换。