①、提高农产品品质、降低有害物质积累，这就是为什么施农家肥的蔬菜、水果，尤其是叶菜类，总是比施化肥的甜、口感好。如西瓜如果多施生物有机肥或农家肥的西瓜比单施化肥的甜。所以施用生物有机肥，可以使农产品提高一个挡次，或达到绿色食品的要求。卖价好，好卖。在无公害蔬菜或水果基地，提倡使用生物有机肥。
②、有效提高耕地肥力、改善土壤供肥环境。施用生物有机肥，能蔬松土壤（沙质变粘、粘土变沙）、改善土壤团粒结构，提高土壤保肥保水能力。如沙质土有机质少保肥、保水能力差。
③、提高肥料利用率。施用生物有机肥：A、可减少肥料养分流失。养分中储存在土壤中，需要时释放出来。有机质少的不能储存，会随水渗漏或流失；B、微生物活动可以分解土壤中被固定的磷钾，提供作物吸收，减少肥料用量。