由于鲜鸡粪臭味大，掺假又严重，现在很多菜农在施肥时改用了干鸡粪。很多菜农在下茬作物定植之前就早早地把干鸡粪撒施在了棚内，但是撒施快一个月了却一直没有翻入土壤，而是将鸡粪裸露在了地表，这样害处很多。
首先，降低了鸡粪的改土作用，还易造成肥料的浪费。鸡粪中含有大量的有机质，深翻入土后能有效地改善土壤板结、减轻盐害症状，达到改土、沃土的作用。而且鸡粪中含氮量较大，如果将其长时间暴露在空气中，极易造成氮肥的损失，降低肥效。
其次，露在地表的鸡粪容易产生有害气体，对定植后幼苗植株的根系和叶片影响很大。现在市场上使用的鸡粪都是烘干鸡粪，只是经过了烘干，臭味小了而已，这种鸡粪也需要进一步腐熟处理才可安全使用。而及时将鸡粪翻入土壤，在土壤微生物的作用下，有利于鸡粪的快速腐熟，而且土壤具有很强的吸附性，鸡粪腐熟过程中产生的氨气等有害气体会被土壤吸附转化，氨气等不能进入空气，也就不会出现气害了。
所以，菜农在棚中使用干鸡粪时，最好是施入地里以后立即进行深翻，然后浇水促进其腐熟发酵，这样经过1-2周的时间，让这些粪肥发酵腐熟完全。另外，鸡粪在腐熟发酵过程中产生的氨气，还会被土壤中的硝化细菌转化为硝态氮，不仅能被作物吸收利用，避免造成浪费，同时还能避免在腐熟发酵过程中造成的蔬菜伤根、熏苗等肥、气害，一举两得。