微波消毒处理过程中产生的废气主要来自于破碎过程中产生的扬尘(含细菌、病毒等、挥发性有机物(挥发性的化学溶剂、蒸气等)及恶臭。
微波消毒过程应在封闭的系统中操作，或者是消毒系统处于负压状态，并使排出的气体通过符合要求微粒空气过滤器等空气净化装置净化后排放。
可根据恶臭产生情况设置脱臭塔等脱臭设施对废气进行处理，达到《恶臭污染物排放标准》(CB)后排放。
微波消毒处理过程中的废水主要来自保病废物盛装容器清洗消妻废水、洗车废水以及量微波消毒处理过程排密的覆液。
废水处理技术可采用多种切实可行的处理技术，但废水中污染物排放指标必须达到《污水综合排放标准》(CB)要求。
移动式医疗废物微波消毒车生产方，一桶桶医疗废物会通过车尾的自动传送带，医疗垃圾处置设备价格，直接送至微波消毒车中毁形、破碎，然后进行45分钟、95摄氏度的微波杀菌、消毒。经过冷却，处理后排出的残渣由密闭的出料系统输送到废渣转运车，终跟随普通生活垃圾一起，进行填埋处理或送到发电厂焚烧。全套设备仅需电力驱动，新型医疗垃圾处置设备，只需一名工作人员便可独立完成操作，可大限度降低能量损耗，湖北医疗垃圾处置设备，节省处理成本。
焚烧处置技术在处置医疗废物的过程中产生二噁l英以及重金属等物质，尤其是废物来料不稳定的情况下，会造成尾气净化方面的诸多问题，微波医疗垃圾处置设备价格，环境风险较大。消毒处理技术是对焚烧处置技术的一种积极补充，其间歇式的运行方式和工艺特点更适合产生量较小、来料不稳定、小规模医疗废物的处理。同时，处理温度多不超过200℃，医疗废物中塑料等含氯高分子化合物不会分解，不会产生二噁l英类致癌物质。
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