矮胖素其生理功能是控制植株的营养生长(即根茎叶的生长)，促进植株的生殖生长(即花和果实的生长)，使植株的间节缩短、矮壮并抗倒伏，促进叶片颜色加深，光合作用加强，提高植株的、抗旱性、抗寒性和抗盐碱的能力。
矮胖素对作物生长有控制作用，能防止倒苗败苗、控长增蘖、株健防倒、增穗增产。对作物生长有控制作用，能防止倒苗败苗、控长增蘖、株健防倒、增穗增产。