全自动常温除氧器系统主要由多个控制隔膜阀（液动或气动）、JMA多阀控制器、除氧罐组成。控制器根据预先设定的程序分别向各个可控隔膜阀给出启闭指令完成各个通路的开断，从而实现运行、反洗、正洗的各个工艺过程。
执行控制的JMA多阀控制器是由一个信号分配器和一个时间控制器构成，固定于防水的控制器外壳内。信号分配器是一个旋转式导向阀，引导液体或气体信号源切换设备上的各个隔膜阀的启闭，从而完成设备系统的自动控制。信号分配器阀芯由坚固耐腐、可自我润滑的材料制成，具有使用寿命长，无需维护的特点。执行操作的阀门选用国内外已经使用非常成熟的液动或气动隔膜阀，这种阀门安装简便、维护方便，非专业人员即可完成检查、维修、更换等操作。