分子量对聚丙烯酰胺絮凝效果的影响
高分子量的聚丙烯酰胺，在分子量范围为105-106之间，通常聚丙烯酰胺的分子量越大，分子链越长，其絮凝效果越好。据研究，絮凝剂的分子量越大，它在微粒表面的吸附速度加快，降低电表面∮电位的能力也提高。这是由于聚合物链加长后，对微粒作用的范德华力增大，同时所带极性基数目也增多。与此相反，分子量较小的有机聚合物（如分子量在104或103以下时），在微粒表面吸附后，因链不太长不但不足以发生桥连作用，而且亲水的或多个带相同符号电荷的极性基团朝向微粒外，使微粒间反而产生斥力不能兼并，也就是发生分散作用，在这种情况下，在一定得范围内，聚合物的相对分子质量越小，分散效果越好。
分子结构（聚合物链弯曲性）对絮凝效果的影响
不但聚合物链的长短对性能有影响，链的弯曲程度也对性能发生影响。对于脂肪烃基长链，即所谓“柔性”长链，在链上的各极性基彼此之间由于氢键的作用使分子卷曲成团状，则降低絮凝剂的作用；对于“刚性”的长链，如纤维素、淀粉等长链，则少发生这种情况。
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