过滤器采用时间或压差方式进行控制，实现全自动运行。时间控制的设备在运行一定时间后开始反冲洗；压差控制方式利用进出口之间的压差作为控制信号，当过滤器拦截的悬浮物达到一定量时，压力损失会迅速增加，当进出水口之间的压差达到设定值时设备自动开始反冲洗。压差控制器同时具备压差、时间、手动三种控制功能，可通过手动按钮进行反冲洗。
5）全自动运行，连续出水：
设备工作过程由专用的PLC控制器控制，工作、反洗状态之间自动切换，不需人工干预，可确保连续出水。即使进水水质发生较大波动系统也可自动适应，进行处理。
过滤器组合中的各单元之间，反洗过程轮流交替进行。