实验室质量控制是为将分析测试结果的误差控制在允许限度内所采取的控制措施。传统意义上，我们通过实验室内质量控制和实验室间比对来进行实验室的质量控制。在实验室内，质量控制一般包括空白实验、校准曲线的核查、仪器设备的标定、平行样分析、加标样分析以及使用质量控制图等。实验室间比对包括分发标准样对诸实验室的分析结果进行评价、对分析方法进行协作实验验证、加密码样进行考察等。它是发现和消除实验室间存在的系统误差的重要措施。可以通过LIMS进行实验室质量的控制。LIMS对质量控制方面的管理体现在两方面，首先是有计划、有目的和针对性的对考核样的处理以及实验室内部和实验室间的比对试验和评价。另一个方面就是在日常检测工作中对质控样品的处理，检测仪器校准曲线,检测结果趋势图和控制图等。