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中国的基金会依据不同标准可以有多种分类：
一、公募基金会和非公募基金会
依据《慈善法》第二十二条 “慈善组织开展公开募捐，应当取得公开募捐资格。依法登记满二年的慈善组织，可以向其登记的民政部门申请公开募捐资格。民政部门应当自受理申请之日起二十日内作出决定。慈善组织符合内部治理结构健全、运作规范的条件的，发给公开募捐资格证书；不符合条件的，不发给公开募捐资格证书并书面说明理由。法律、行政法规规定自登记之日起可以公开募捐的基金会和社会团体，由民政部门直接发给公开募捐资格证书。”的规定，慈善基金会可以分为公募基金会和非公募基金会。
公募基金会可以公开募捐，例如中国扶贫基金会就是公募基金会。
公开募捐资金的方式，《慈善法》也有规定。第二十三条 “开展公开募捐，可以采取下列方式：
（一）在公共场所设置募捐箱；
（二）举办面向社会公众的义演、义赛、义卖、义展、义拍、慈善晚会等；
（三）通过广播、电视、报刊、互联网等媒体发布募捐信息；
（四）其他公开募捐方式。
慈善组织采取前款第一项、第二项规定的方式开展公开募捐的，应当在其登记的民政部门管辖区域内进行，确有必要在其登记的民政部门管辖区域外进行的，应当报其开展募捐活动所在地的县级以上民政部门备案。捐赠人的捐赠行为不受地域限制。
慈善组织通过互联网开展公开募捐的，应当在国务院民政部门统一或者指定的慈善信息平台发布募捐信息，并可以同时在其网站发布募捐信息。”
从上述规定可知，公募基金会一般需在登记的民政部门辖区内通过报纸、广播等媒体或者慈善晚宴等多种方式募集资金。非公募基金会不得以上述方式进行募捐，不过可以进行非公开的定向募捐。中国非公募基金会数量庞大，很多基金会在募捐方面工作绩效欠佳，甚至因为资金匮乏而运营困难。鉴于这种情形，《慈善法》逐步放开了对基金会公开募捐的限制，在经过一定考核满足一定条件的情况下可以从非公募基金会转为公募基金会。
二、资助型基金会和项目执行型基金会
基金会依据运营方式的不同可以区分为资助型基金会和项目执行型基金会。依据《基金会管理条例修正案》草案征求意见稿，在全国民政部注册的基金会只能是资助型基金会。此外，著名企业家卢德之设立的华民基金会是资助型基金会，他认为他的价值和长处在于赚钱，设立基金会直接资助其他慈善组织开发和执行慈善活动，也算是发挥长处为社会做贡献。
三、家族基金会和非家族基金会
家族基金会和非家族基金会不是法律上的分类，而是学理上的分类。家族基金会是社会公众对具有明显家族特质、由某特定家族发起设立并由其家族成员主要参与运营的基金会的通俗称谓。家族基金会和非家族基金会的区别在于：首先，出资的独立性，即家族基金会的资金来源于某家族的自有资金或者基金会资金日后的增值，而非外部募集；其次，完善的组织架构和运营，这也是家族基金会的一个重要特征。最后，家族成员持续不断地参与慈善。这是区别一个基金会是否为家族基金会的重要特征。例如海航集团的股东慈航基金会，目前虽然基金会创始人协同公司员工积极做慈善，然而由于基金会资金来源的多样性，以及创始人的后代未必全力参与基金会的慈善活动，这就是一个企业基金会，而不可能是一个家族基金会。
中国的基金会历史还非常年轻，一个基金会由一个家族的两代人都参与的还是比较少的。这其中比较有代表性的是老牛基金会。老牛基金会由蒙牛创始人牛根生在内蒙古出资创立，后来牛根生的子女效仿美国洛克菲勒家族世代做慈善的典范，又在北京创了了“老牛兄妹公益慈善基金会。”成为中国“善二代”的代表。牛根生及子女两代人全心参与慈善，开发和执行了很多诸如儿童博物馆等项目，享誉中西慈善界。老牛基金会可谓中国家族基金会的代表。另外一个值得提起的是爱建特种基金会—简称爱建基金会。爱建基金会是中国老一辈民族工商业者的杰出代表、著名爱国人士和社会活动家、中国人民政治协商会议第八届全国委员会副主席刘靖基创立的，爱建基金会是爱建信托、爱建证券的股东。爱建集团和中信集团、光大集团是中国三大具有红色背景的民营企业。爱建集团的创始人刘靖基老先生过世后，他的子女仍然在爱建基金会下属的商业集团任职，发挥重要作用。
四、永续型基金会和非永续型基金会
依据存续期限进行区分，基金会可以区分为永续型基金会和非永续型基金会。永续存在的基金会可以无限期存续，例如诺贝尔基金会。非永续存在的基金会在完成一定任务或者延续一定年限后进行清算，剩余资产归入慈善宗旨相似相似的慈善基金会。基金会并非存续越久越好，因为随着时间的变迁，基金会的慈善宗旨可能已经没有存在的必要或者无法找到受益人。例如设立一个以资助中国贫困地区儿童教育为目的的慈善基金会，也许二十年后我们已经实现共同富裕，消灭了贫困，儿童都可以接受优质公立教育，此类基金会就丧失存续的意义。
五、依据基金会创始人背景的不同，基金会也有诸多分类。