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聚醚类TPU内的醚基与聚酯类TPU内的酯基的极性不同，以及分子结构存在差异，而导致醚基一般在酯基树脂中的兼容性差，所以将两者混合起来就会出现分层现象，另外还与醚键的分子间作用力有较密切的关系，此外，聚酯的结晶性一般比聚醚的结晶性强很多，故其兼容性亦较差。但并不是所有的醚类都这样，因为PTMG（聚四氢呋喃）的结晶性和聚酯的结晶性差不多，因此用PTMG合成的聚醚类TPU与聚酯类TPU的兼容性就稍好一些，在合成过程中是可以进行合成的，只不过其加工后的各项物理性能还是会大大下降，得不偿失，故亦没有必要进行该项共混。