单克隆抗体是由氨基酸组成的一类免疫球蛋白，其本质是一种蛋白质。而二代测序技术是一种DNA测序技术，其测序原理是根据DNA的性质决定的，因此不能直接用于检测蛋白质，但是可以利用反转录法则获得编码单克隆抗体的cDNA序列，再通过二代测序技术检测cDNA的序列，根据遗传信息的中心法则可以推导单克隆抗体的氨基酸序列。简而言之，二代测序技术不能直接检测单克隆抗体，但是可以根据反转录获得的编码单克隆抗体的DNA从而间接实现单克隆抗体氨基酸序列测定，基于PCR扩增的单克隆抗体测序方法就是根据这一原理发展起来的。
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