造成下游企业计税基础减少
主要途径有2个：
1）定额征收企业在定额范围内存在、虚开专用或普通的行为，对下游企业的所得税税基造成侵蚀。
2）定率征收企业由于实际税负低，存在承担少量税款而开具大量用于下游企业按25%税前扣除的情况（特别是关联企业），侵蚀企业所得税税基。
4、造成上游企业税款流失
按收入定率征收企业或定额征收企业，由于没有支出也不影响所得税的计算，可能不向上游企业索取，将导致上游企业藏匿收入，少缴增值税和消费税。
随着税收现代化服务的不断推进，核定征收程序流于形式，核定的税额未能反映企业的实际纳税能力，造成税源的损失，容易滋生税收腐败等问题。逐步实现取消核定征收，能减少税源损失、保证了税收的公平性。
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