是的，胶原蛋白办理CE认证过程中，通常会进行GMP考核。
GMP（Good Manufacturing Practice）是药品生产质量管理规范，旨在确保药品的生产过程符合规范要求，确保药品的安全性和有效性。在胶原蛋白办理CE认证过程中，认证机构会对企业的生产过程进行全面的评估和考核，以确认其是否符合GMP的要求。
GMP考核通常包括对企业生产环境、设备、人员、文件记录等方面的检查。认证机构会对企业的生产流程、质量控制、物料管理等方面进行详细的评估，以确保产品的生产过程符合CE认证的要求。
需要注意的是，具体的GMP考核要求和流程可能因产品特性和认证机构的要求而有所不同。因此，在进行胶原蛋白CE认证前，建议咨询机构或认证机构，了解具体的GMP考核要求和流程。