科技计划项目验收不通过的原因，不同地方科技部门也都不一样，如山东省：被验收项目存在下列情况之一者，其验收申请不予批复：
1、完成合同任务不到85%，或关键创新指标未完成；
2、提供的验收材料、数据不真实；
3、擅自修改合同考核目标、内容、技术路线；
4、研究过程及结果等存在纠纷尚未解决；
5、项目存在经费挪用、违规使用等重大问题；
6、超过合同规定的执行年限半年以上且事先未经批准的。
河北省沧州市：
凡有下列情况之一的，不予通过验收：
1.规定的主要任务和指标未完成；
2.所提供的验收文件、资料、数据不真实，存在弄虚作假行为；
3.未经批准，项目承担单位、项目负责人、考核目标、研究内容、技术路线等发生变更；
4.存在经费挪用、违规使用等重大问题或未通过专项经费审计；
5.实施过程中出现重大问题，但未能解决和做出说明，或研究过程及结果等存在纠纷尚未解决的。