上海互联网药品信息服务资格证新办流程及注意事项如下：
流程：
1. 准备申请材料，包括《互联网药品信息服务申请表》和《关于申请互联网药品信息服务的说明》，并加盖企业公章。
2. 直接向上海市食品药品监督管理局递交申请材料。
3. 等待审核结果。如果审核通过，将获得互联网药品信息服务资格证书。
注意事项：
1. 必须保证所提交材料的真实性，一旦发现虚假材料，将取消申请资格。
2. 申请者必须是依法设立的企业，持有营业执照和医疗机构许可证。
3. 申请者不能在互联网药品信息服务的介绍中宣传治疗作用，只能提供以供用药咨询、药品合理用药指导或者中药处方服务为主的互联网药品信息服务。
4. 药品生产企业、药品经营企业、医疗机构不得与第三方平台合作，由第三方平台代为申请互联网药品信息服务资格证书。
5. 办理时间较长，需要耐心等待。
具体的流程和注意事项可能会根据实际情况有所变化，建议咨询相关部门获取准确信息。
