开便利店超市办理食品经营许可证的步骤如下：
名称预核准：首先，申请人（经营者）需要提供身份证复印件，到当地工商局进行名称预核准。
申请食品流通许可证：取得核名通知后，向工商局申请食品流通许可证。申请时需提供申请人（经营者）的健康证明（由当地疾控中心办理）和身份证复印件。
使用场地证明：如果便利店是自有财产，需要提交房屋产权证明复印件；如果是租赁的房屋，则需要提交租赁协议复印件和出租人的房屋所有权证明复印件。
申请工商营业执照：在取得烟草经营许可证和食品流通许可证后，向工商局申请工商营业执照。
此外，值得注意的是，申请食品经营许可需遵循“先照后证”原则，即应先行取得合法主体资格。同时，已取得的《食品流通许可证》、《餐饮服务许可证》、《保健食品经营备案表》在有效期内继续有效，期间如需变更或到期延续，则按“新办”程序办理。申请人还需满足《食品经营许可管理办法》第11条规定的申请条件