办理药品经营许可证的方式主要有企业自己办理和第三方代理，很多人错误地认为企业不需要花钱自行处理药品经营许可证，找中介结构会被骗，其实这是错误的。只要找到第三方服务、可信的合作企业，只要整理相关资料，就能获得证明，而不需要花费很多时间和精力。
但是也需要一定的预算，第三方服务商的价格与其规模密不可分，因此，企业要想找到合适的价格，只要在可能规模较大的公司里找到与自己相似、服务好的第三方即可。
药品经营许可证办理需要准备的资料
1、申请药品经营许可证企业的营业执照副本。
2、申请药品经营许可证的企业需要填写互联网药品资质的申请表。
3、申请药品经营许可证企业需要2名医药相关专门人员的学历证明、专门技术资格证、简历。
4、申请药品经营许可证企业的网站域名证。
5、申请药品经营许可证企业的网站栏目的设置说明。
6、申请药品经营许可证的企业需要有网络与信息安全确保的措施。
7、网站对历史发布信息进行备份与查阅的相关管理制度执行情况说明。
8、药品监督管理部门在线浏览网站上所有栏目、内容的方法及操作说明等。