出口巴基斯坦时，办理FTA（Free Trade Agreement）原产地证书的流程如下：
1. 了解FTA协议：首先需要了解中国与巴基斯坦之间的自由贸易协定（FTA）的相关规定，确认需要办理FTA原产地证书。
2. 准备所需资料：根据巴基斯坦的进口要求和中国的出口规定，准备所需的资料，如出口货物的发票、装箱单、运输单据、产品说明书等。
3. 在中国国际贸易促进委员会（贸促会）或当地海关办理：前往中国国际贸易促进委员会或当地海关，提交所需资料并申请办理FTA原产地证书。
4. 填写申请表：按照要求填写申请表，包括出口货物的详细信息、生产商信息、运输信息等。
5. 审核和签发：提交申请后，贸促会或海关将对所提交的资料进行审核。审核通过后，将签发FTA原产地证书。
6. 注意事项：在办理过程中，需要确保所提供的资料真实、准确、完整。此外，还需要注意证书的有效期和有效期内的使用次数。
另外，不同种类的原产地证书可能具有不同的办理流程和要求，因此请在办理前仔细阅读相关规定和要求，确保顺利完成办理。
以上信息仅供参考，具体流程和要求可能因实际情况而有所不同。建议在办理前咨询当地贸促会或海关的官方工作人员，以获取最准确的信息和指导。