米娅分销商城小程序APP原生系统的开发，主要可以参照一般小程序分销商城系统的功能模块来设计，以下是一个详细的功能模块划分：
一、商品模块
实物商品：展示已经审核通过的实物商品，当商品处于上架状态时前台显示。商品分类：商家添加商品的时候需要选择对应的商品分类，用户可以根据商品分类搜索商品。
虚拟商品：展示已经审核通过的虚拟商品，当商品处于上架状态时前台显示。电子卡密：已经审核通过的卡密商品，当商品处于上架状态时前台显示，用户购买之后可以直接获得卡密。
商品管理：包括商品上下架、价格修改、库存调整、商品详情编辑等功能。同时，可以设置商品限购、商品评价、相册管理、商品服务、售后保障等。
二、店铺装修模块
店铺装修：可以设置编辑属于自己的店铺主页，支持跳转其他小程序、增加视频组件等功能。
分类展示：可以设置编辑属于自己的分类页面样式。
微页面：微页面是用户打开的具体内容页面，可以实现自定义页面，不同模块组合及样式的自由编辑，也可快速复制。
底部导航：可以设置编辑属于自己的店铺底部导航。
商城风格：可以根据个人喜好设置主题风格。
广告管理：商家可以通过选择所属广告位来获取该广告位下的所有广告。
三、会员模块
会员注册与登录：提供手机+验证码、账号密码、第三方自动注册（如微信公众号、微信小程序）等多种注册登录方式。
会员信息管理：包括会员昵称、数量、账户等信息的展示和管理。
会员等级：设置会员不同等级的升级条件和折扣率，提升用户黏性。
会员标签：商城为了更加有效的对会员进行管理和分组，可以对会员设置相应的标签，方便查找和管理。
会员导入与导出：支持对会员信息的批量导入和导出。
会员群体操作：可以针对符合条件的会员群体进行批量操作，如发放优惠券、调整积分等。
四、订单模块
订单管理：包括订单列表、订单导出、物流订单、外卖订单、自提订单等功能。订单列表以列表的形式显示订单价格、销量、库存等信息，可通过交易单号、商户单号查询订单。
发票管理：设置发票的税号、抬头等信息，可进行开票操作。
退款维权：会员用户对商品的退换货申请，商家可主动发起退款。
五、营销模块
优惠券：设置优惠券活动的面额、发放数量、领取条件、有效期等，增加推广链接。
满减送：设置商品满减送活动有效期、商品、优惠条件和方式。
限时折扣：设置商品限时折扣活动有效期和商品。
限时：设置商品限时活动有效期和商品，增加推广链接。
组合套餐：设置商品组合套餐活动的多种商品、套餐价格、上下架等。
分销推广：设置不同推广员等级升级条件及给上级的佣金比率，实现分销裂变。
六、统计模块
店铺统计：商家对自身经营状况下的实时概况统计。
商品统计：商家对自身经营状况下的商品浏览统计。
交易统计：商家对自身经营状况下的订单交易统计。
访问统计：商家对自身经营状况下的店铺访问统计。
会员分析：商家对自身经营状况下的会员分布统计。
七、应用模块
积分商城：设置积分兑换数以及商品价格数，商品可以同时设置购买形式（只积分兑换、积分+商品价格兑换），实际订单按照运费以及积分进行折算兑换。
小程序直播：在小程序中实现直播互动和商品销售的闭环。
积分抵现：商品设置积分抵现比率，系统设置积分兑换比率，类似天猫积分或者淘宝金币，实际订单进行折算。
八、设置模块
系统设置：包括系统参数设置、安全设置、支付设置等。
通知管理：支持站内通知、短信通知、邮件通知等多种通知方式。
其他设置：如首页浮层设置、自定义模板设置等，以满足商家的个性化需求。
此外，针对米娅分销商城小程序APP的具体需求，还可以考虑增加以下功能模块：
分销等级与奖励：详细划分分销等级，并设置相应的奖励机制，以激励用户积极参与分销活动。
团队红包与动态奖励：根据用户的不同等级和贡献，发放团队红包和动态奖励，进一步提升用户积极性。
数据报表与分析：提供详细的数据报表和分析功能，帮助商家更好地了解用户行为和市场趋势，从而制定更有效的营销策略。
综上所述，米娅分销商城小程序APP原生系统开发的功能模块应涵盖商品、店铺装修、会员、订单、营销、统计、应用和设置等多个方面，以满足商家的全方位需求。同时，结合米娅商城的具体特点和需求进行定制开发，将进一步提升商城的竞争力和用户体验。