食品经营许可证是针对食品销售流通环节、销售区域而言申请的，凡是从事食品销售和餐饮服务活动，应当依法取得食品经营许可。比如我们经常看见的饭店、商店、大学超市、冷饮店、面包店等等都是需要办理食品经营许可证的。凡是涉及到食品销售流通的都需要办理该项许可证，基本上个体工商户、个人独资企业都是需要办理的，由药监局下放资质。
食品生产许可证也就是通常所说的QS，是针对食品生产加工环节、生产区域而言申请的，并且是针对生产性质的组织颁发的证书。比如比如从事糕点、豆制品、白酒、乳制品、特殊膳食食品、特殊医学用途配方食品、婴幼儿配方食品等等生产活动的企业法人、合伙企业、个人独资企业、个体工商户等，需由市一级食药监局审核办理《食品生产许可证》，县(区)级食药监局提供咨询服务。