上海互联网药品信息服务资格证书的办理流程和所需材料如下：
办理流程：
1. 受理：申请人网上提交申请材料，材料不齐全或不符合法定形式的，应当当场或者在五日之内一次性告知申请人需要补正的内容，对能够通过其他方式获取的资料不予收取，对不属于本部门职权范围或者申办内容不明确的申请，不予受理。
2. 审查决定：在受理之日起7个工作日内完成审查并做出决定。
3. 颁发证书：准予许可的，在10个工作日内制作并发放证书。
所需材料：
1. 《互联网药品信息服务申请表》；
2. 营业执照或者企业名称预先核准通知书；
3. 法定代表人、负责人身份证明复印件；
4. 专职联系人身份证复印件、学历证明复印件和联系方式；
5. 提供保障互联网药品信息服务的设施和熟悉互联网药品信息服务业务的人员名单；
6. 审核同意的药品生产经营资质证明（如《药品经营许可证》等）复印件；
7. 公司章程等工商注册资料；
8. 申请网站的有效域名、IP地址、托管商以及申请单位与托管商签订的合同；
9. 保证金缴纳证明；
10. 房屋租赁合同及复印件和住所(场地)使用证明；
11. 申请单位自审报告、承诺书；
12. 申请单位公章。
以上信息仅供参考，具体流程和所需材料可能因为实际情况而产生变化。建议咨询相关部门获取具体信息。
