申请上海二类医疗器械备案凭证的流程和所需资料如下：
一、办理流程：
1. 准备相关资料：包括《第二类医疗器械经营企业备案表》2份（正反打印）、企业营业执照复印件1份（需加盖公章）、负责人身份证复印件1份（正反面），所有资料都需要加盖公章。
2. 递交资料：前往上海市浦东新区川沙新镇民汇路1000-1200号递交以上资料。
3. 领取备案凭证：在上海市浦东新区市场监督管理局窗口自取或邮寄领取《第二类医疗器械经营备案凭证》。
二、办理条件：
需要满足以下条件：
1. 有店面：需要有一个独立的医疗器械零售场所，且面积在20平方米以上。
2. 有资质：经营人员需要具备相关的医疗器械经营知识和能力，并经过相关培训和考核。
此外，还需符合以下要求：
1. 经营方式符合当地市场监管部门的规定和要求。
2. 经营场所距离医院、药店等距离在合理范围内。
具体条件可能会根据政策变化而变化，建议在申请之前到相关部门进行详细咨询。
具体流程可能因地区而异，建议直接向上海市浦东新区市场监督管理局咨询，以确保准确无误。
此外，办理二类医疗器械备案需要按照流程，正确填写备案表和提交相关资料。建议您认真阅读相关政策文件，确保备案的合法性和合规性。
