中国出口巴基斯坦办理FTA原产地证需要的资料主要包括：
1. 填写完整的《中华人民共和国原产地证明书/加注中巴FTA专有栏目》（FORM E）原产地证格式表格；此表格必须逐项准确、完整地填写。
2. 形式发票或出口货物发票（Invoice）的副本或副本扫描件。发票应包括：发证人的名称和地址、出口货物的详细描述、出口货物的总价和价值、交易双方的关系以及出口货物的具体信息等。
3. 出口货物装箱单（Packing List）副本或副本扫描件，需包括货物详细清单。
4. 商业合同副本或副本扫描件，即买卖双方签署的合同或协议。
5. 出口货物的运输单据，如提单（Bill of Lading），应显示运输公司名称、目的地等关键信息。
6. 如涉及到其他相关证书，如产品认证证书、检验检疫证书等，也需要一并提交。
请注意，这些文件可能因具体商品和贸易情况有所不同，建议在申请前先向当地的原产地证办理机构或海关进行详细咨询。
另外，如果是在中国境内注册的企业办理FTA原产地证，还需准备以下材料：企业申请表、营业执照、法定代表人身份证、与中巴FTA有关的企业贸易关系文件等。具体的资料可能因企业的实际情况而有所不同，因此还需要企业仔细了解相关规定并做好相关准备工作。
此外，需要注意的是办理过程和政策可能有所变动，建议及时关注官方信息以获取最新要求。