代理协议阿联酋驻华大使馆认证的流程大致如下：
1. 准备相关文件：首先需要准备好需要认证的代理协议文件以及其他相关文件，如公司的营业执照、法人代表身份证明等。
2. 翻译文件：由于大使馆可能只接受阿联酋语或中文的文件，所以如果代理协议是其他语言，需要进行翻译并加盖翻译公章。
3. 递交至阿联酋驻华大使馆：将所有文件递交给阿联酋驻华大使馆。大使馆将验证所提交的文件是否齐全且准确。
4. 提交至海牙或领事机构进行认证：递交到大使馆之后，阿联酋可能会要求进一步的领事或海牙认证，根据不同国家的情况可能有所不同。
5. 等待审核：提交的文件需要经过大使馆的审核和核实，这一过程可能需要一些时间。
6. 领取认证文件：审核通过后，代理协议将会被加盖大使馆的印章或签署认证书，表明其已经被大使馆认证。
在具体操作过程中，可能会因不同地区或具体情况有所差异，所以建议与当地相关部门进行咨询或请专业的第三方代理服务机构来办理此类业务。这些服务机构有丰富的经验和专业知识，能够更快地帮助您完成这一过程。
此外，也要注意，涉及到外交事务的官方认证程序可能会随着政策的变动而发生变化，所以办理之前需要提前查询最新的政策规定。