代理协议阿联酋驻华大使馆认证的流程大致如下：
1. 准备文件：首先需要准备好需要认证的代理协议文件。同时，还需要准备其他相关文件，如申请表、公司营业执照等。
2. 翻译文件：由于大使馆认证需要官方语言的文件，因此需要将代理协议文件翻译成阿联酋官方语言（阿拉伯语），并加盖翻译公司的公章。
3. 递交申请：将准备好的文件递交到阿联酋驻华大使馆。可以通过代理代办或亲自递交的方式完成。
4. 审核文件：阿联酋驻华大使馆会对递交的文件进行审核，确认文件的真实性和完整性。
5. 缴纳费用：在文件审核通过后，需要缴纳认证费用。具体的费用可以咨询阿联酋驻华大使馆或相关代理机构。
6. 等待认证结果：等待阿联酋驻华大使馆的认证结果。如果文件符合要求，大使馆会在文件上加盖认证章并出具认证书。
7. 取回认证文件：取回经过阿联酋驻华大使馆认证的代理协议文件和其他相关文件。
需要注意的是，不同地区和不同类型的大使馆可能会有不同的要求和流程，因此具体操作前**先咨询当地的大使馆或相关机构，以确保流程的顺利进行。
此外，由于涉及到跨国合作和官方认证，建议选择有经验和专业资质的代理机构协助完成此项工作，以确保文件的真实性和合法性。