土壤生物学指标：
菌落总数、大肠菌群、大肠杆菌、霉菌、酵母菌等各类常规微生物
肠杆菌科、嗜渗酵母、粪链球菌、粪大肠菌群、肠杆菌属等非常规微生物
微生物量碳、微生物量氮、生物多样性等
脲酶、过氧化氢酶、磷酸酶、蔗糖酶、纤维素酶、蛋白酶等
有机质、胡敏酸、富里酸、腐殖质等
土壤有害成分：
化学有害成分、物理有害成分、生物有害成分、放射性有害成分
土壤污染物指标：各类农药残留检测、各类抗生素检测
土壤营养指标：有机质、全氮、速效钾、速效磷、速效氮、酸碱度、碳氮比、阳离子交换量
土壤代谢组学分析：土壤中各类代谢物分析
土壤理化等检测项目：
水分、pH、全氮、全磷、全钾、水解氮、有效磷、速效钾、铵态氮、氨氮、硝态氮、硝酸盐氮、亚硝酸盐氮、全盐量、氡含量、水溶性盐总量、钾离子、钙离子、钠离子、镁离子、氯离子、硫酸根、碳酸氢根、碳酸根、水溶性和酸溶性硫酸盐、阳离子交换量、交换性钙、交换性镁、交换性钾、交换性钠、交换性盐基总量、盐基饱和度、有机质、有机碳、颗粒组成（机械组成）、微团聚体组成、容重、烧失量、碳酸钙、有效硫、有效硅、有效硼、有效态锌、石油类(矿物油)、硫化物、挥发酚、氰化物、氟化物、六六六、滴滴涕、苯并（a）芘、挥发性有机物、半挥发性有机物、多氯联苯、艾氏剂、狄氏剂、异狄氏剂、环氧七氯、七氯、有机磷农药（速灭磷，甲拌磷，二嗪磷 ，异稻瘟净，甲基对硫磷 、杀螟硫磷，溴硫磷 ，稻丰散，杀扑磷）