在石景山区，办理便利店超市食品经营许可证需要准备以下材料：
准备申请书，包括企业法人营业执照、税务登记证、组织机构代码证、食品安全管理人员聘任证书、场地租赁协议等相关证件和材料。
准备与食品经营相适应的主要设备设施布局、操作流程等文件。
提供企业负责人、质量负责人、代理人身份证明、健康证、学历证明。
准备经营管理制度和申报材料真实性承诺。
准备经营设施及设备清单。
如果有需要，还需准备当地管理局要求的其它资料。
办理流程如下：
准备材料。
通过石景山区的相关网站或移动APP，在线填写申请表格，并上传准备好的材料。
提交申请后，石景山区的相关部门会进行现场审核。审核人员将核实申请材料的真实性和完整性。
审核通过后，需要缴纳相应的费用。缴费后，可进行下一步的办理。
经过审核和缴费后，石景山区的相关部门会颁发相应的许可证。经营者可凭借领取凭证去指定地点领取许可证。
以上信息仅供参考，具体流程和所需材料可能因各地要求而有所不同，建议咨询相关部门或者机构获取具体信息。