申请海淀区食品经营许可证需要准备以下材料：
食品经营许可申请书；
营业执照或其他主体资格证明文件复印件；
与食品经营相适应的主要设备设施布局、操作流程等文件；
食品安全自查、从业人员健康管理、进货查验记录、食品安全事故处置等保证食品安全的规章制度。
如果申请者委托其他人办理食品经营许可申请，还需提交以下材料：
代理人需要提交授权委托书以及代理人的身份证明文件；
若代理人不是申请者的法定代表人，还需要提交申请者委托该代理人提交申请的证明文件。
以上信息仅供参考，如果还有疑问，建议咨询海淀区市场监督管理局。