1、投资主体可能会被中止或者停止实施境外投资并处以警告。对投资主体及有关责任人处以警告，构成犯罪的，依法追究刑事责任。
2、如果提供融资、担保的，将依法依规处罚。金融企业为属于核准、备案管理范围，但为未取得备案的项目提供融资和担保的，由国家发改委通报违规行为并商请有关金融监管部门依法依规进行处罚。
3、实际操作中最大影响——外汇进出受限。无法通过银行汇出投资资金，也无法回流境外公司的利润分利。
4、境外子公司要返程投资国内，未备案则无法进行返程投资。
5、无法享受国内的相关补贴和奖励，包括境外知识产权纠纷和“两反一保”（销与反倾销;补贴与反补贴;保障措施和特别保障措施）应诉补贴等。
境外投资备案登记 一手代办企业境外投资备案 海外投资备案需要怎么办理 一手代办企业境外投资 疑难代办各种案例