4D-PRM靶向蛋白质组学

4D-PRM靶向蛋白质组学服务简介

       PRM（平行反应监测，Parallel Reaction Monitoring）目前靶向蛋白质组学数据采集的主流方法，通过对特异性肽段或目标肽段（如发生翻译后修饰的肽段）进行选择性PRM（Parallel Reaction Monitoring）是目前靶向蛋白质组学数据采集的主流方法，通过对特异性肽段或目标肽段进行选择性检测，从而实现对目标蛋白质/修饰肽段的靶向相对或定量。

       景杰生物于近期隆重推出一代，全覆盖、高精准的靶向蛋白组学产品-4D-PRM，为靶向蛋白组学验证提供新的强大工具，助力各位老师科研工作。4D-PRM技术，结合4D蛋白质组学特有的捕获离子淌度（TIMS）进行第四维度分离，相对于普通的PRM提高了定量的选择性和准确性，并结合PASEF的高扫描速度，大幅提高靶向蛋白验证通量，实现全覆盖、更精准的TargetProteomics分析。

技术原理

       4D-PRM利用了4D平台特有的捕获离子淌度技术——TIMS进行第四维度分离，相对于普通的PRM提高了多肽离子的选择性和灵敏度，并结合了PASEF的扫描速度从而增加了靶标离子的数量，实现全覆盖、更精准的检测，为靶向蛋白组学验证带来更多的可能。

图1 4D-PRM技术示意图

仪器设备

Bruker timsTOF Pro/Pro2 质谱仪

Exploris 480质谱仪

技术优势

1、差异蛋白验证的全覆盖

       4D-PRM方法可在较短的液相梯度内对超过200个差异蛋白进行PRM检测，且对于蛋白组定量结果验证成功率高达80%。蛋白组结果中intensity排名靠后的蛋白依然能够保证很好的验证效果，展现其较高的灵敏度。

 

图2 4D-PRM能够实现差异蛋白验证全覆盖

2、定量更准确

       新增离子淌度多一维的筛选，使4D-PRM对离子具有更强的选择性。在Ion Mobility Filter打开时，利用离子淌度这多一维度，能有效区分相同质荷比但形状和截面不同的离子，产生更强的离子选择性。4D-PRM快速的扫描能力能采集到更多的数据点，极大的提高定量验证的准确性。

图3 离子淌度分离让4D-PRM具有更高的选择

应用领域

       4D-PRM具有高灵敏度、扫描速度和选择性等优势，并在高靶向离子数的应用下展现高度重现性及精准定量，解决了传统PRM面临的问题。除了常规蛋白组研究中差异目标蛋白的验证，4D-PRM能够可靠地定量分析潜在的候选生物标记物，为靶向蛋白质组学技术在大队列生物标志物验证和临床转化应用方面带来更多可能。

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