修饰位点同源性分析

修饰位点同源性分析应用场景

       比较不同物种间同源蛋白发生特定修饰的位点的交叠情况。

分析方法

       使用 BLAST 方法对给定物种的蛋白序列进行同源比对分析，通过适当的过滤条件，筛选出直系同源蛋白。用 MUSCLE 软件对找到的同源蛋白进行多序列比对。根据多序列比对结果，统计相互比较的两个物种在相同比对位置发生特定修饰的位点数，并以韦恩图展示。

图表展示

       注：不同物种间同源蛋白鉴定到修饰位点的比较分析Venn图。交叠部分为同源蛋白相同比对位置发生相同修饰的位点个数。

参考文献

       Altschul, S. F. . (2012). Basic local alignment search tool (blast). Journal of Molecular Biology, 215(3), 403-410.

       Edgar, R. C. . (0). Muscle: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nuclc Acids Research(5), 1792-1797.