磷酸激酶分析

磷酸激酶分析应用场景

       磷酸激酶催化高能供体分子的磷酸基团转移到底物，这一过程为磷酸化，一般而言磷酸化的目的是“激活”或“能化”底物分子。蛋白激酶在细胞的信号传导及复杂的生命活动中起到了广泛而重要的作用。我们针对磷酸化修饰定量项目鉴定到的磷酸化位点预测上游磷酸激酶调控关系，进行激酶活性分析，进而构建激酶-磷酸化位点调控网络并可视化。磷酸激酶相关生物信息学分析结果可以为后续激酶实验提供参考方向。

分析方法

       基于序列相似性原理，采用GPS或iGPS软件预测激酶-磷酸化位点调控关系。由于磷酸化表达水平能够反映激酶的调控状态，我们通过GSEA方法分别对样本和比较组的磷酸激酶活性进行预测，以富集分析方法得到的NES值作为激酶活性得分评估激酶活性。根据激酶与磷酸化位点之间复杂的调控关系，针对每一个比较组，筛选出活性显著激活或抑制的磷酸激酶与表达水平显著差异的磷酸化位点构建激酶调控网络。

图表展示

注：激酶与底物磷酸化位点调控关系表格。

       注：激酶活性得分（NES）条形图。红色代表激酶可能活性较高，处于激活状态；蓝色代表激酶可能活性较低，处于抑制状态。

       注：激酶活性聚类热图。聚类热图横向为样本或比较组，纵向为激酶。在多表型样本研究中，激酶活性聚类热图可以方便我们观察激酶活性在相同表型中的共性，或不同表型中的特异性。探索激酶活性与表型的潜在联系，从而进一步筛选感兴趣的激酶为后续实验提供参考。

       注：激酶调控网络图。网络由显著激活或抑制的激酶与差异表达的磷酸化位点构成，圆形代表磷酸化位点，三角形代表激酶蛋白。本分析提供网络的cys格式文件，支持Cytoscape软件进一步编辑和美化。后续可以深入分析网络拓补结构，在复杂的网络中发现关键的调节激酶。

参考文献

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