泡沫的控制，可以采用两种途径：1、调整培养基中的成分(如少加或缓加易起泡的原材料)或改变某些物理化学参数(如pH值、温度、通气和搅拌)或者改变发酵工艺(如采用分次投料)来控制，以减少泡沫形成的机会。但这些方法的效果有一定的限度，2、采用机械消泡器或消泡剂消泡这两种方法来消除已形成的泡沫。还可以采用菌种选育的方法，筛选不产生流态泡沫的菌种，来消除起泡的内在因素，如用杂交方法选出来不产生泡沫的土霉素生产菌株。对于已形成的泡沫，工业上可以采用机械消泡器和化学消泡剂消泡或两者同时使用。
机械消泡器消泡这是一种物理消泡的方法，利用机械强烈振动或压力变化而使泡沫破裂。有罐内消泡和罐外消泡两种方法。前者是靠罐内消泡浆转动打碎泡沫；后者是将泡沫引出罐外，通过喷嘴的加速作用或利用离心力来消除泡沫。该法的优点是：节省原料，减少染菌机会。安丘银翼机械生产的消泡器可实现百分之百消泡，不需消泡剂，无任何环境污染问题，而且还具有结构紧凑、运行可靠、操作维护简便的优点。
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