注册上海二类医疗器械公司申请备案的具体步骤和详细材料如下：
步骤：
1. 确定公司名称、注册资本、公司地址、法人及股东身份证信息。
2. 填写并提交申请医疗器械经营许可证的材料，包括《申请表》、《授权书》、《公司名称壳》、《注册资金壳》、《股权结构图》、《公司场地证明文件》等。
3. 提交完成后，等待相关部门审核。审核通过后，办理正式的许可证。
详细材料：
1. 身份证复印件：法人身份证复印件和法人联系方式，以及所有股东身份证复印件（如果由法人代表本人来办理，只需提供身份证原件并复印即可）。
2. 拟申请的经营范围：根据实际情况填写，后加盖企业公章。
3. 公司股东资格证明：公司房产证复印件，或者租赁合同原件及房产证复印件（如果是租用），以及出租方的房产证复印件并由双方签字盖章。
4. 其他相关证件：如果不是免试范围，还需提交相关证明文件。
注意事项：
1. 所有复印件都要带原件到窗口进行身份核对，并复印原件。
2. 以上许可证的经营范围中若涉及体外诊断试剂的，需要具有生物安全柜或生物安全柜指引、通风系统，而且需进行核查和日常监管的登记管理事项变更手续等。
以上步骤和材料仅作参考，建议咨询上海相关部门了解详细步骤和材料。
