合同在土库曼斯坦大使馆进行认证加签的流程和注意事项如下：
一、流程：
1. 准备相关文件：需要准备合同文件，确保文件清晰、完整。
2. 翻译文件：如合同非土库曼语，需准备土库曼语翻译件。
3. 递交至大使馆：将合同及翻译件递交至土库曼斯坦大使馆。
4. 提交认证申请：在大使馆窗口提交认证申请，并缴纳相关费用。
5. 等待审核：大使馆将对提交的文件进行审核，确认无误后将进行加签。
6. 完成加签：审核通过后，大使馆将在合同上加盖印章并签名，表示认证加签完成。
二、注意事项：
1. 了解土库曼斯坦的相关法律法规，确保合同内容符合当地法律法规要求。
2. 确保合同翻译的准确性，避免因翻译错误导致误解或纠纷。
3. 提交的文件应齐全、清晰，确保大使馆能够顺利审核。
4. 缴纳相关费用时，请确保费用准确无误，避免因费用问题导致加签延误。
5. 跟踪加签进度，如有问题及时与大使馆联系。
三、其他建议：
1. 在递交文件前，建议先咨询专业人士或律师，确保合同内容和形式符合土库曼斯坦的法律要求。
2. 在加签过程中，如遇到问题或需要帮助，可联系土库曼斯坦大使馆或相关机构寻求帮助。
3. 完成加签后，建议保留一份加签合同的副本，以备将来查阅和参考。
以上信息仅供参考，具体流程和要求可能因实际情况而有所不同，建议在办理前咨询土库曼斯坦大使馆或相关机构获取最准确的信息。