上海第二类医疗器械经营备案的流程和要点如下：
首先，需要明确的是，办理上海第二类医疗器械经营备案需要遵循一定的步骤和准备相应的材料。具体流程包括：
登录并注册账号：
登录上海市市场监督管理局官网，进入“二类医疗器械经营备案信息系统”平台1。
仔细阅读相关声明，输入企业信息，注册账号并设置密码1。
填写并提交备案信息：
使用注册的账号密码登录备案系统1。
点击“备案信息填报”，根据企业实际情况填写相关信息，并上传相关证照（如营业执照、公章等）12。
确保填报事项真实、准确、完整，核对无误后提交12。
审核与领取备案凭证：
提交后，系统会进行审核，企业可查看审核结果1。
如审核通过，可进行电子化备案，并打印《第二类医疗器械经营备案凭证》1。
在备案过程中，还需注意以下要点：
公司资质要求：
具备合法的公司营业执照34。
拥有至少三名医疗器械、药学或相关的人员3。
具有实际经营场所，且面积需大于50平方米的商用地址3。
材料准备：
公司营业执照复印件或扫描件23。
法定代表人、企业负责人、质量负责人的身份证明、学历或职称证明复印件或扫描件23。
房屋租赁合同、房屋产权证明复印件或扫描件，以及经营场所、库房地址的内部平面布局图23。
备案后的注意事项：
第二类医疗器械经营备案凭证的有效期是长期的，但需遵守相关监管要求，确保合规经营3。
如填报事项发生变更，需及时更新备案信息1。
此外，办理过程中如遇到困难，可以咨询企业所在地市场监督管理部门或寻求人士的帮助13。
****，上海第二类医疗器械经营备案是一个涉及多个步骤和要点的工作，需要企业认真准备并严格按照流程操作。