申请合同尼泊尔大使馆认证需要准备以下资料和按照一定的办理流程：
一、所需资料：
1. 合同原件及复印件。
2. 申请人的有效护照原件及复印件。
3. 尼泊尔大使馆认证申请表。
4. 如果是公司之间的合同，需要提供公司的营业执照、税务登记证等相关证明文件。
5. 其他可能需要的文件，如公证处要求的其他证明文件等。
二、办理流程：
1. 准备所需资料：按照上述要求准备好所有需要的资料。
2. 填写申请表：填写尼泊尔大使馆认证申请表，并加盖公章（如有）。
3. 递交申请：将申请表和所有相关资料提交至尼泊尔大使馆或其认证机构。
4. 等待审核：大使馆或其认证机构会对提交的合同进行审核，确认其真实性和合法性。
5. 缴纳费用：根据大使馆或其认证机构的要求，缴纳相应的认证费用。
6. 获取认证：审核通过后，大使馆或其认证机构会出具合同认证书。
7. 使用认证书：获得认证书后，可以将其用于尼泊尔的商务活动或其他需要使用的地方。
请注意，具体的办理流程和所需资料可能因尼泊尔大使馆或其认证机构的要求而有所不同，建议在办理前先与大使馆或其认证机构联系，确认具体的办理流程和要求。