在阿联酋驻华大使馆进行代理协议的认证是一个较为复杂的程序，涉及到的具体流程和步骤可能会根据具体的需求和协议的内容而有所不同。一般来说，这样的认证程序是为了确保协议的真实性和合法性，并确保在阿联酋境内得到承认和执行。以下是代理协议阿联酋驻华大使馆认证的一般步骤：
1. 准备必要文件：首先需要准备代理协议的原始文件，包括协议的副本或复印件。此外，还需要提供一些其他必要的文件，如公司营业执照、法人身份证明等。
2. 提交申请：将准备好的文件提交给阿联酋驻华大使馆，并填写相关的申请表格。
3. 审核文件：大使馆会对提交的文件进行审核，以确保文件的真实性和合法性。如果文件不完整或存在错误，大使馆可能会要求补充或更正。
4. 缴纳费用：根据大使馆的规定，需要缴纳一定的认证费用。费用的具体数额可能会根据不同的协议和文件而有所不同。
5. 认证过程：在文件审核通过并缴纳费用后，大使馆会开始进行认证过程。这一过程可能需要一定的时间，具体时间取决于大使馆的工作效率和协议的复杂性。
6. 领取认证文件：一旦认证完成，大使馆会通知申请人领取认证文件。通常情况下，申请人需要亲自前往大使馆领取文件，或者通过邮寄等方式获取文件。
需要注意的是，以上步骤仅供参考，具体的流程和要求可能会因地区和具体情况而有所不同。因此，在进行代理协议阿联酋驻华大使馆认证之前，建议先咨询专业的律师或相关机构，以确保了解具体的流程和要求。