1、从定义和功效来看
国食健字：针对具有保健功效的食品进行审批，分为注册制和备案制，注册制由国家药监总局审批，备案制由省药监局审批。
食字号：针对无任何功效的普通食品进行审批的一种批号
2、从申报主体来看
国食健字：申报主体必须为具备GMP认证的保健食品工厂，分为注册制和备案制
食字号：申报主体可以是具有食品生产许可证的生产企业也可以是经营范围包含“食品销售”的普通公司，在个别省市申报主体只能是生产企业。
3、从审批费用和周期来看
国食健字：有27种功能，每一种功效费用不同，平均费用80-100万左右，周期3年左右
食字号：费用9800，时间2-3个月
4. 从销售渠道来看
国食健字：药店、超市、微商，较少在医院销售
食字号：超市、微商、网上商城，不可在医院和药店销售