北京市地下空间备案办理需要按照以下步骤进行：
1.准备材料：备案申请书、地下空间利用方案、地下空间使用权证、地下空间建设项目规划许可证等相关证明文件。
2.前往北京市规划和自然资源委员会（原北京市国土资源局）办理。
3.提交申请材料并进行审核。审核通过后，领取备案证书。审核时间一般在20个工作日左右。
4.根据备案证书规定的期限，在备案证书有效期内，按照备案证书规定的要求进行使用和管理。
注意事项：
在备案前，需先办理地下空间建设项目规划许可证。
地下空间使用权证必须符合法律法规要求，且使用权人必须是合法持证人。
地下空间利用方案必须符合规划要求和法律法规要求。
在备案证书有效期内，如有变更需重新备案。
需要提醒的是，备案申请过程中如有问题，具体的流程可能会因情况而异。