圆二色谱（Circular Dichroism，CD）即圆二色光谱，是根据待测光学活性物质的圆二色性解析其分子结构的技术，在蛋白质的二级结构鉴定中具有重要地位。多肽与蛋白质都是具有不对称空间结构的光学活性生物分子，可以利用其圆二色性通过圆二色光谱技术进行二级结构分析，如α-螺旋、β-折叠和β-转角等立体结构。
圆二色谱测定多肽等物质的空间结构主要是通过测定分子的椭圆度[θ]来实现的，椭圆度[θ]表示光学不对称性多肽分子对左、右圆偏振光不同程度的吸收。多肽主要有两个紫外吸收峰，在280nm处的吸收峰主要是由芳香族侧链（主要是Tyr、Trp、Phe）引起的，在波长约低于230nm处的吸收峰则主要由肽链骨架本身电子位移的跃迁和其他氨基酸侧链的电子跃迁引起的，因而通过分析230nm区域附近的圆二色光谱图可以分析多肽主链的构象。
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