在鱼菜共生系统中，菜的种植就是采用就是水培、雾培以及基质培，在这里的基质培只能选用岩棉基质。对于水培与雾培来讲，它营养成分主要是来源养殖中鱼的粪便进行一系列的发酵，形成作物生长需要的肥料。这个与传统的无土栽培基本类似，经过植物吸收后，还会流入到养殖区域，不过经过种植设施的水需要经过过滤处理，才能再次流入到养殖区域中。
IAVS系统即潮汐砂培（粒培）系统，养殖水体被抽吸到砂培种植床并通过水泵的定时开闭来实现种植床的潮汐，水体中的有机物质被过滤并沉积在砂床的表面，微生物对不断积累的有机物质进行分解矿化，给植物提供养分，植物吸收净化后的水体再回到养殖区，实现养殖水体的循环利用。
虹吸粒培系统是在IAVS系统基础之上演变而来，砂培种植床被分隔为单个介质（陶粒、鹅卵石、砾石、火山岩等）种植箱，箱内部设置虹吸装置，夏体式鱼池搭配种植箱。养殖水体被抽吸到种植箱，水位达到一定高度后虹吸自启动，将种植箱内的水排掉，残饵和粪便被介质过滤，并在箱内被微生物逐步分解矿化，给植物提供营养，鱼菜共生技术，被介质过滤以及植物吸收净化后的水体再回到鱼池，从而实现养殖水体的循环利用。
种植浮床制作及成本生产上常见的浮床类型有PVC管浮床、泡沫板浮床、塑料浮岛浮床和竹子浮床等，其中以PVC管浮床应用广。PVC种植浮床用PVC胶将PVC管和直角弯头粘接密封，制成长方形框架，框架上层和下层包聚乙烯网片，浮床底部下挂网纱，用以保护水培蔬菜根系。PVC管浮床的规格不宜过大，避免搬挪困难，生产上常见的浮床规格长2m×宽1m或长1.5m×宽0.8m。
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