蛋白质差异分析

蛋白质差异分析应用场景

       在定量组学研究中，往往不同实验条件下的样本在蛋白或修饰位点水平的表达变化情况来研究复杂的生物调控机制。采用合适的统计学分析方法，对明显变化的蛋白或修饰位点的准确识别是后续分析的基础。

分析方法

       在定量组学研究中，采用蛋白或修饰位点在实验组和对照组中的信号比值（Ratio）作为衡量其在两种状态下的表达量差异。为确保表达差异在统计学上的显著性，通过多次（三次或三次以上）重复实验结果计算差异显著性检验 T-test p value。当 Ratio 大于指定阈值且 p value 小于 0.05 时认为蛋白或修饰位点是显著差异的。

图表展示

       注：不同比较组中差异蛋白个数分布柱形图。横轴为不同的比较组；纵轴为差异表达蛋白的数目；其中红色为差异表达上调蛋白、蓝色为差异表达下调蛋白。

       注：差异表达蛋白火山图。 横轴为实验组与对照组差异表达变化 Ratio 值经过 log2 转换后的值 ； 纵轴为统计检验 T-test p value 经过 -log10 转换后的值；其中红色点表示蛋白在 A 样本组相对 B 样本组显著差异上调，蓝色表示显著差异下调，灰色表示无显著差异。