宏蛋白质组学

应用场景

       宏蛋白质组学是应用蛋白质组学技术对微生物群落进行研究的一项新技术，在特定的时间对微生物群落的所有蛋白质的组成进行大规模的鉴定。宏蛋白组能够提供微生物在生态系统中的功能信息，它有望把微生物群落的遗传和功能多样性联系起来，对于不同环境的宏蛋白组分析可以捕捉新的功能基因和代谢途径、鉴定与特异性胁迫有关的蛋白，蛋白组学联合宏基因组学数据可以更好的揭示环境群落分类多样性、功能多样性和生物过程。

分析方法

       将非标定量技术、高效液相色谱分级技术以及基于质谱的定量蛋白质组 学技术等一系列前沿技术的有机结合，对样本进行定量宏蛋白质组学的研究。为了分析样本中的物种组成信息，我们使用Unipept软件预测肽段对应物种的分类（taxonomy）信息，物种相对丰度值为样本中所有比对到该物种的peptides intensity总和占所有peptides intensity总和的比例。使用Krona 软件对物种注释结果进行动态可视化展示。

图表展示

       物种相对丰度柱状图。 柱状图展示了样本中主要物种的组成比，横坐标代表不同样本，纵坐标表示该样本中物种的相对比例。

       物种组成Krona动态展示图。 网页形式的动态展示结果中，圆圈从内到外依次代表不同的分类级别，扇形的大小代表不同物种注释结果的相对比例