蛋白质组学与Bottom up和Top down是两种不同层次的概念，蛋白质组学是研究蛋白质组的组成及其活动规律的科学，而Bottom up和Top down是两种不同的蛋白质质谱分析策略。Bottom up即“自下而上”质谱策略，又称鸟枪法蛋白质组学，其特点是通过直接检测蛋白质酶解得到的肽段来实现完整蛋白质的鉴定，该方法将液相色谱技术与质谱技术结合起来，其分析思路先将蛋白质进行多重酶解得到小分子肽段，再利用液相色谱技术分离不同的肽段，zuì后将分离后的肽段进行质谱分析，根据质谱信号结合生物信息学分析手段鉴定各肽段，将各个肽段拼接成完整的蛋白质zuì终实现完整蛋白质的鉴定。常用的蛋白质质谱定量技术如Label Free、SILAC、TMT和iTRAQ等都是基于“自下而上”策略实现的。Top down即“自上而下”质谱策略，与“自下而上”质谱策略相反，该技术直接对完整的蛋白质进行分析，可以保留“自下而上”分析策略中大部分被破坏的具有不稳定结构蛋白质的特征。
百泰派克生物科技采用Thermo公司zuì新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪结合Nano-LC纳升色谱技术，提供Top down自上而下蛋白质组学与Bottom up自下而上蛋白质组学服务技术包裹，用于蛋白质鉴定、蛋白质测序、PTMs表征、蛋白质结构表征以及相对和jué对定量分析等，欢迎免费咨询。
百泰派克生物科技-生物药物表征，生物质谱多组学优质服务商
北京百泰派克生物科技有限公司（Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP）从事以生物质谱为依托的生物药物表征，大分子物质（包括蛋白质、多肽、代谢物）质谱分析以及小分子物质检测服务。
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