CUT&Tag
服务简介
CUT&Tag是一种利用高活性Tn5转座酶锚定技术进行高效、高分辨率DNA测序文库构建的方法,适用于蛋白质-DNA互作研究[1]。

图1.CUT&Tag技术文章引用数逐年攀升
技术原理
CUT&Tag技术使用Protein A/G融合的转座酶 ,在抗体引导下精准靶向目的蛋白,并在目的位点附近进行DNA的片段化。
技术优势
实验耗时短,效率提升神器
CUT&Tag利用高活性的Tn5转座酶,在切割DNA的带上测序接头,简化实验流程,缩短实验时间,堪称效率提升神器。

图2.CUT&Tag 与传统ChIP的流程与耗时比较[2]
高信噪比,节约测序费用
CUT&Tag由于使用原位结合和切割,极大地提高了实验结果的信噪比。由下图可见,使用50M reads的ChIP-seq结果勉强达到使用8M reads的CUT&Tag结果。

图3.不同测序量的ChIP-seq,CUT&Tag,CUT&RUN的IGV结果[1]
适用性广,转录因子富集信号更显著
CUT&Tag对于低丰度的蛋白(如转录因子)的DNA富集效果显著由于ChIP-seq。

图4. 在平行测试中,转录因子CTCF在CUT&Tag实验中的信号最强[1]
稀有样本shouxuan,最低可实现60细胞投入量
CUT&Tag尤其适合用于稀有样本,如细胞数量有限的原代细胞、流式分选后的细胞,胚胎细胞等等。由下图可见,60、600、6000个K562细胞的CUT&Tag结果相差不大。

图5.CUT&Tag可实现低至60细胞的高分辨率解析[1]
景杰生物 CUT&Tag 技术服务优势
自研抗体 品质保证
与ChIP-seq类似,CUT&Tag成败的关键因素之一是抗体的选择,因为其是精准指导Tn5结合基因组位置的重要因素。景杰生物拥有自主抗体开发平台和十余年抗体开发经验,在表观修饰类抗体研发上拥有juejia优势。CUT&Tag 技术服务全部采用自研的ChIP级别抗体,决胜CUT&Tag关键环节。

图6.景杰生物CUT&Tag服务全部使用高特异性的ChIP级别抗体
创新修饰 触达未知
景杰生物在表观修饰类抗体深耕十余年,在新型酰化修饰领域独树一帜,该类产品销量也在全球遥遥领“酰”。景杰生物可提供各种组蛋白新型酰化修饰CUT&Tag技术服务,搭建代谢-表观研究桥梁,创新技术加持创新研究,共同突破未知边界。

图7.创新发现的新型酰化修饰抗体
景杰生物 CUT&Tag 实测数据

图8.文库质控图,文库片段主要集中在200-700 bp之间,质量良好

图9.组蛋白H3K18la(抗体货号:PTM-1427RM,兔单抗) 和H4K8la(抗体货号:PTM-1415RM,兔单抗)IGV截图

图10.H3K18la 实测数据与文献报道数据呈现相似的peak分布比例 [3]

图11.组蛋白H3K18la修饰(左)和H4K8la修饰(右)在TSS 分布热图

图12.组蛋白H3K18la修饰Peak邻近基因KEGG Pathway富集分析

图13.组蛋白H3K18la修饰Peak邻近基因GO富集分析

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