空间磷酸化修饰组学
服务简介
蛋白质磷酸化修饰是最常见和功能最重要的一种翻译后修饰。几乎所有的细胞信号通路都受到磷酸化修饰的精密调控,磷酸激酶抑制剂也已广泛应用于临床。空间背景下的磷酸化修饰对于更深层次的机制研究以及临床应用而言具有重要意义。
景杰生物基于丰富的技术开发和项目经验,不断克服技术难题并优化实验方法,dujia推出空间磷酸化修饰组学,联合空间蛋白组的空间多组学策略,为解析空间维度分子特征及分子靶标提供更多可能。

技术原理

仪器设备
Thermo Scientific Orbitrap Astral
Bruker timsTOF Pro
Bruker timsTOF Pro2/HT
Zeiss PALM MicroBeam
技术优势
景杰生物空间蛋白质组学技术兼容各类包埋组织(FFPE、OCT)或切片(空间磷酸化修饰组目前jinxian冰冻切片类样本),兼顾多种染色方法 (HE/IHC/IF),并支持激光捕获显微切割及显微辅助切割,为空间组学研究提供无限可能。
作为蛋白质组学与修饰组学分析xingyelingpaozhe,景杰生物拥有业内最高格、全面类型的蛋白质质谱仪集群。随着首批Orbitrap 最新款高分辨率质谱仪的引进,进一步扩充了景杰生物的质谱平台性能。Orbitrap 最新款质谱仪在检测通量、蛋白覆盖深度、灵敏度及精准定量等多个维度进行了革命性的升级,与空间组学技术和景杰独有的翻译后修饰技术相结合,将在时空蛋白质组学上凸显其zhuoyue的性能。 景杰生物配备了覆盖空间蛋白组学样本制备全流程的先进仪器设施,如德国莱卡冷冻切片机、数字玻片扫描系统和德国蔡司激光捕获显微切割仪,可提供一站式全流程服务。 空间蛋白质组学对区域的精细化切割要求极高。景杰生物在采用HE/IHC/IF染色成像技术实现组织区域或细胞类型识别后,再结合激光捕获显微切割LCM技术,按照指定的圈画区域准确获取某个特定的细胞群。该流程可实现细胞级个性化切割,极大地提升了复杂空间结构研究的灵活性与适用性。其分辨率高至0.005~0.01 mm2,也保障了空间蛋白质组研究的精细度和准确性。 由于蛋白质无法类似DNA一样进行扩增,单个细胞仅包含约150 pg的蛋白质。与其他空间组学技术相比,超微量样本下的空间蛋白质组的分析更具有挑战性。超高灵敏度色质谱技术的兴起,使空间蛋白质组分析成为可能。景杰生物Spatial DIA空间蛋白组技术,最高可实现6000+空间蛋白组的鉴定深度和5000+的空间磷酸化鉴定深度,高精度、高深度、高重复性地呈现空间微尺度分子景观。图6 我司空间蛋白组、空间磷酸化修饰组深度实测数据 为了确保在如此超微量样本前处理及组学检测时的稳定性,景杰生物严格控制样品制备及数据检测。如图所示,在相邻三张片子上在同一位置切割组织作为三次重复,分别检测得到的数据中,三次重复间的Pearson相关系数大于0.95。 相较于常规蛋白组学,空间蛋白组学在样本前处理上的复杂环节对于技术熟练度及样本处理经验的要求极高。景杰生物作为国内最早推广空间蛋白组学的公司,已完成超80余项空间蛋白组项目,处理超过700例样本的显微切割,丰富的项目经验能够为高复杂、高要求、高精度的空间组学项目保驾护航。
应用领域
筛选潜在生物标志物
作为国内推广空间蛋白组学最早的公司,景杰生物基于自持的全流程高精密仪器,可实现高精度、高深度、高重复性的一站式空间蛋白组检测,结合全球首发的空间磷酸化,对于深入理解蛋白质的功能和调控机制,阐明生理或疾病过程中的关键步骤,从而在指导药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。