植物单细胞蛋白质组学
服务简介
随着技术的不断进步，植物研究正逐步迈向微观世界的新纪元，单细胞组学研究的重要性日益凸显。为更好地满足对单细胞蛋白组学研究的需求，景杰生物凭借多年来的深厚积累与不懈创新，持续攻克单细胞蛋白质技术的难题。公司于2021年8月业内首发推出“真”单细胞蛋白质组学，开启了单细胞蛋白质组学的新篇章。并在2024年6月革新推出“单细胞蛋白质组学2.0”，实现单细胞层面的高通量分析。
近日，针对植物的分析难题，景杰生物行业首发 “植物单细胞蛋白质组学”的创新成果。该技术基于四大平台体系的革新飞跃，实现植物组织→细胞悬液→单细胞分选前处理→单细胞蛋白精准鉴定→单细胞蛋白组生信分析的全流程服务，深度解锁植物微观新视界，为植物科学研究带来前所未有的精准洞察。
图1 景杰生物植物单细胞蛋白质组全流程解决方案
仪器设备
Thermo Scientific Orbitrap Astral
Bruker timsTOF Pro2/HT
技术优势
1、多样化分选平台-针对客户多样化的单细胞分选需求，景杰生物精心准备的两种高效分选平台均能提供的支持。 单细胞无偏分选：在构建不同细胞类型的细胞蛋白表达图谱或鉴定不同细胞类型的功能研究中经常需要对复杂样本的多种细胞进行大规模分析。针对这一研究需要，景杰生物基于的全流程集成自动化的前处理平台CellenONE，实现从细胞悬液到单细胞制备体系的全流程集成自动化，实现真正的单细胞无偏分选。图2 针对无偏分选场景，景杰生物单细胞蛋白质组分选平台工作流程 单细胞特定分选：在探究某种特定类型的细胞群在生长发育、胁迫响应或信号传导等生物学过程中的机制研究需要对目的细胞进行分析。针对这一研究需要，景杰生物将使用超高速流式细胞分选平台，在满足高速温和分选及高纯度下提供的解析度，样本类型适配纳米到微米级别的多尺寸；含有多荧光通道，满足多细胞群类型分选。图3 针对特定分选场景，景杰生物单细胞蛋白质组分选平台工作流程2、单细胞前处理平台：针对植物单细胞分析难题，景杰生物自主研发精简高效的蛋白前处理体系，极大提升植物单细胞的蛋白提取效能；融合自身丰富项目经验，自主创新开发“一步提取法”取代了传统繁琐“多步提取法”，化繁为简，大幅减少样本损耗，提升组学定量深度。3、10X Proteomics质谱平台：景杰生物作为蛋白质组学领域的企业，率先开发并推出全新高深度10X Proteomics技术并运用于单细胞蛋白组学，在单细胞的检测通量、灵敏度及精准定量等多个关键维度实现了重大突破，极大地提升了植物单细胞蛋白质组学的分析性能。根据我们的测试数据，针对50颗玉米胚根细胞的单细胞蛋白质组学分析，蛋白质检测平均深度高达4000+，总深度超6200+，达到植物单细胞蛋白组学前所未有的覆盖深度！4、专属单细胞生信分析平台：针对单细胞的创新分析需求，景杰生物原创开发单细胞蛋白质组学专属生信分析流程，为植物细胞异质性研究、精细蛋白分子图谱构建等提供本质的精准信息，助力深入探索植物单细胞的生物学机制！参考文献
案例1. 单细胞蛋白组解析拟南芥根细胞类型异质性
文章标题：Single-cell proteomics differentiates Arabidopsis root cell types研究概述：通过单细胞蛋白质组，研究人员能够更深入地理解植物细胞的复杂性和功能，为植物生物学和作物改良提供重要信息。在该研究中，作者重点关注拟南芥根部的皮层和内皮层两种相邻细胞类型，这两种细胞类型源自共同的干细胞系，但在功能上有所不同。研究从756个根细胞中鉴定出3763种蛋白质，平均每个细胞1118种蛋白质。596种蛋白质在皮层或内皮层中的表达富集，能够区分这些密切相关的植物细胞类型。这项研究不仅展示了单细胞蛋白质组在植物研究中的潜力，还为未来在植物细胞类型鉴定和功能研究中提供了新的工具。案例2. 单细胞蛋白组揭示拟南芥叶片干旱胁迫响应新机制
文章标题：Single-cell proteomics of Arabidopsis leaf mesophyll identifies drought stress-related proteins样本信息：不同程度干旱胁迫和对照处理下的拟南芥叶片研究概述：单细胞蛋白质组能够更深入地探索植物细胞在不同环境条件下的功能和响应机制，助力植物生物学和作物改良研究。本研究从单个原生质体中平均鉴定出2873种蛋白质，在严重水分胁迫条件下，鉴定出160种核糖体蛋白的丰度显著下降，表明植物在干旱条件下可能通过降解核糖体来重新分配氨基酸和核酸资源。通过单细胞蛋白质组数据构建了蛋白质共变异网络，揭示了干旱胁迫下蛋白质-蛋白质相互作用的变化。
